موارد زیر از جمله مهمترین مأموریت های مرکز آپا دانشگاه بجنورد می باشند :
- مطالعه و تهیه ابزارهای لازم در جهت شناسایی و تحلیل باج افزارها
- ارزیابی امنیتی شبکه های کامپیوتری سازمان ها
- آزمون نفوذپذیری شبکه های رایانه ای
- امداد رخدادهای رایانه ای
- اطلاع رسانی و آگاهی بخشی در حوزه امنیت سایبری
فعالیت‌های مرکز آپا دانشگاه بجنورد را در حوزه آگاهی رسانی می‌توان در ۳ گروه دسته بندی کرد :
- تغییر و ارتقای نگرش مدیران و بستر سازی در دیدگاه‌های مدیریتی
- آگاهی رسانی و ارتقای دانش عمومی جامعه از امنیت فضای تبادل اطلاعات
- ارتقای دانش و توان فنی متخصصین حوزه فناوری اطلاعات